精准扶贫户住院花费5000元，根据相关政策，报销情况如下：
- 基本新农合报销 ：
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建档立卡贫困户住院乡级报销90%，县级80%，市级75%，省级65%。
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假设在县级医院住院，基本新农合报销比例为80%，则报销金额为5000元 × 80% = 4000元。
- 大病保险报销 ：
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大病保险报销起付线由5000元降至3000元，因此5000元的费用在起付线以上，可以参与大病保险报销。
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高额费用患者大病保险再报销，具体比例为0-1万元报销80%，1-2万元报销90%，2-5万元报销95%，超过5万元报销98%。
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由于总费用为5000元，未达到5万元，因此按90%的比例报销，即报销金额为4000元 × 90% = 3600元。
- 总报销金额 ：
- 基本新农合报销4000元 + 大病保险报销3600元 = 7600元。
因此，精准扶贫户住院花费5000元，最终报销金额为7600元。
建议 ：
- 由于各地政策可能有所不同，建议咨询当地医保经办部门或拨打当地社保咨询服务热线12333，以获取最准确的报销信息。
